登場敵組織（追加）
ジャシーン帝国
創造主ジャシーンを崇める機械生命体の帝国。有機物で出来た生命体は下等であるという考えを持っており、宇宙警察だけでなくドーマやギガロとも敵対している。『ジャシーンの遺産』と呼ばれる物を探しており、そのために地球にやって来た。地球のメカを『発達の遅れた悲しい物たち』と呼んでいる。
国際生物研究所
表向きは生物の遺伝子などを研究している機関だが、裏では遺伝子操作で生み出した生物兵器を秘密裏に売りさばいており、テストやデモンストレーションの為に暴れさせる。本来、危険度Aランクに認定されている生物（主に怪獣や宇宙生物）の遺伝子を使ってクローン等を作り出す事は禁止されているが、ここで生み出された生物兵器はその殆どがAランクの生物の遺伝子を利用している。
登場中立組織
クトゥルー教団
クトゥルーと呼ばれる存在を神と崇める集団。１年前までアメリカで活動していたが、現在は日本で活動している。防衛軍、セントラル・コーポレーション、ネオジョーカー、新世界党、新世人、クライム団、ブラックマジックなど様々な組織に手を貸している。構成員、資金源、技術力、目的など色々と謎の多い集団で、協力関係にあるどの組織もその実態を掴みきれていない。
呪われし星の民
遥か昔に滅びてしまった名も無き星の生き残りの末裔。その者たちは生まれながらの戦闘種族で、様々な能力を持っているとされ、宇宙警察からも特別凶悪犯罪者として追われている。当人達は生まれた瞬間から自分達の宿命を知る様に遺伝子を操作されている。